Dra. Selene Zárate Guerra
GRADO ACADÉMICO
Doctorado en Ciencias Bioquímicas. Instituto de Biotecnología. Universidad Nacional Autónoma de México.
Estancia Postdoctoral. Dra. Isabel S. Novella. Department of Microbiology and Immunology. Medical College of Ohio.
Estancia Postdoctoral. Dr. Simon Frost. Antiviral Research Center. University of California.
NIVEL SNI: I
LÍNEAS DE INVESTIGACIÓN
Genómica de agentes infecciosos en humanos.
Genómica de agentes infecciosos de importancia veterinaria.
PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN
1. Evolución y dinámica de virus de RNA.
Los virus de RNA son capaces de evolucionar rápidamente, ésto es producto de su tasa de mutación, los grandes tamaños poablacionales y su velocidad de replicación. Estas características hacen de los virus de RNA patógenos capaces de evadir de manera efectiva al sistema inmune y que desarrollan resistencia a las drogas antivirales de manera rápida. Sin embargo, cada uno de estos virus utliza difenrentes estrategias que le permiten establecerse en una población de hospederos. Al realizar estudios comparativos de la evolución de diferentes virus lograremos establecer paralelos y contrastes en la evolución viral.
2. Relaciones genotipo-fenotipo en el virus de la inmunodeficiencia humana.
Las relaciones de genotipo-fenotipo no son siempre claras. Para estudiarlas analizaremos como la varibilidad genética de las proteínas de capa externa del VIH determina los patrones de neutralización heteróloga.
3. Efecto del hospedero en la evolución viral.
La evolcuión de los virus de RNA esta sujeta a presiones selectivas ejercidas por el hospedero, para anañizar como influye el genotipo del hospedero en el genotipo del virus, se analizaran casos clínicos en los que se cuenta con los haplotipos de los pacientes para los genes HLA-A, -B y -C, la secuencia del gen pol del virus, y marcadores de progresión de la enfermedad, como son la carga viral y la cuenta de linfocitos CD4.
4. Modelos epidemiológicos de enfermedades de transmisión sexual.
Utilizando autómatas basados en agentes se construiran modelos de brotes epidémicos tomando en cuenta variables de comportamiento, como la tendencia a permanecer en parejas estables, y genéticas, como la susceptibilidad a la infección, de los hospederos. Proyecto PICDS08‐17 apoyado por el ICyT-DF.
PUBLICACIONES REPRESENTATIVAS
Artículos internacionales
Smith D.M., Zárate S., Shao H., Pillai S.K., Letendre S.L., Wong J.K., Richman D.D., Frost S.D., Ellis R.J.; HNRC Group. 2009. Pleocytosis is associated with disruption of HIV compartmentalization between blood and cerebral spinal fluid viral populations. Virology. En prensa.
Presloid J. B., B. E. Ebendick-Corpus, S. Zárate, and I. S. Novella. 2008. Antagonistic pleiotropy involving promoter sequences in a virus. J. Mol. Biol. 382:342-352.
Kosakovsky Pond, S. L., A. F. Y. Poon, S. Zárate, D. M. Smith, S.J.Little, S.K. Pillai, R.H. Ellis, J.K. Wong, A.J. Leigh Brown, D. D. Richman, and S.D.W. Frost. 2008. Estimating selection pressures on HIV-1 using phylogenetic likelihood models. Stat. Med. 27:4779-4789.
Zárate, S., S. L. Kosakovsky Pond, P. Shapshak, and S.D.W. Frost. 2007. Detecting intra-patient compartmentalization of HIV-1 populations. J. Virol. 81:6643-6651.
Novella. I.S., B. Ebendick-Corpus, B., S. Zárate, and E.L. Miller. 2007. Emergence of mammalian-adapted vesicular stomatitis virus from persistent infection of insect-vector cells. J. Virol. 81:6664-6668.
Zárate, S. and I. S. Novella. 2004. Vesicular stomatitis virus evolution during alternation between persistent infection in insect cells and acute infection in mammalian cells is dominated by the persistence phase. J. Virol. 78:12236-42.
Novella, I.S., S. Zárate, D. Metzgar and B. E. Ebendick. 2004. Positive selection of synonymous mutations in an RNA virus. J Mol. Biol. 342:1415-21.
Zarate S., R. Espinosa, P. Romero, C. F. Arias and S. López. 2004. VP7 mediates the interaction of rotaviruses with integrin αvβ3 through a novel integrin-binding site. J. Virol. 78:10839-47.
Zarate S, Cuadras MA, Espinosa R, Romero P, Juarez KO, Camacho-Nuez M, Arias CF, Lopez S. 2003. Interaction of rotaviruses with Hsc70 during cell entry is mediated by VP5. J Virol. 77 :7254-60.
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Guerrero, C. A., E. Mendez, S. Zárate, P. Isa, S. Lopez, and C. F. Arias. 2000. Integrin αvβ3 mediates rotavirus cell entry. Proc Natl Acad Sci U S A. 97:14644-14649
Zárate, S., R. Espinosa, P. Romero, C. A. Guerrero, C. F. Arias, and S. Lopez. 2000. Integrin α2β1 mediates the cell attachment of the rotavirus neuraminidase-resistant variant nar3. Virology. 278:50-54
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Zárate, S., R. Espinosa, P. Romero, E. Méndez, C. F. Arias, and S. López. 2000. The VP5 domain of VP4 can mediate attachment of rotaviruses to cells. J Virol. 74:593-599.
CAPÍTULOS EN LIBROS
Arias, C.F., C.A. Guerrero, E. Méndez, S. Zárate, P. Isa, R. Espinosa, P. Romero and, S. López. 2001. Early events of rotavirus infection: the search for the receptor(s). In Gastroenteritis Viruses. Novartis Foundation, John Wiley and Sons Ltd. UK.
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